Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCCP43146 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCCP43146 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCCP43146 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCCP43146 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCCP43146 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCCP43146 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCCP43146 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCCP43146 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCCP43146 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCCP43146 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCCP43146 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCCP43146 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCCP43146 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCCP43146 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCCP43146 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCCP43146 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
DCCP43146 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCCP43146 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCCP43146 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCCP43146 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCCP43146 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCCP43146 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCCP43146 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCCP43146 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCCP43146 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCCP43146 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
DCCP43146 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCCP43146 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
DCCP43146 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCCP43146 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCCP43146 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCCP43146 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DCCP43146 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DCCP43146 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DCCP43146 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DCCP43146 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DCCP43146 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DCCP43146 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DCCP43146 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DCCP43146 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
DCCP43146 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DCCP43146 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DCCP43146 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DCCP43146 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DCCP43146 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DCCP43146 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DCCP43146 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DCCP43146 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DCCP43146 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DCCP43146 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
DCCP43146 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DCCP43146 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
DCCP43146 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
DCCP43146 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DCCP43146 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DCCP43146 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DCCP43146 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DCCP43146 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DCCP43146 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DCCP43146 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DCCP43146 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DCCP43146 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DCCP43146 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DCCP43146 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
DCCP43146 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DCCP43146 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DCCP43146 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DCCP43146 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DCCP43146 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DCCP43146 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DCCP43146 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DCCP43146 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCCP43146 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCCP43146 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCCP43146 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCCP43146 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCCP43146 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCCP43146 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCCP43146 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCCP43146 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCCP43146 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
DCCP43146 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCCP43146 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCCP43146 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCCP43146 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCCP43146 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCCP43146 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCCP43146 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCCP43146 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCCP43146 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DCCP43146 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DCCP43146 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DCCP43146 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DCCP43146 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DCCP43146 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DCCP43146 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DCCP43146 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DCCP43146 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DCCP43146 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms