Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEACAM3P40198 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms