Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPGP40121 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPGP40121 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPGP40121 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPGP40121 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPGP40121 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPGP40121 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPGP40121 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPGP40121 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPGP40121 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPGP40121 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPGP40121 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPGP40121 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPGP40121 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPGP40121 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPGP40121 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPGP40121 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPGP40121 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPGP40121 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPGP40121 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPGP40121 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPGP40121 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPGP40121 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPGP40121 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPGP40121 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPGP40121 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPGP40121 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPGP40121 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPGP40121 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPGP40121 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPGP40121 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPGP40121 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPGP40121 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPGP40121 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPGP40121 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPGP40121 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPGP40121 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPGP40121 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPGP40121 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPGP40121 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPGP40121 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPGP40121 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPGP40121 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPGP40121 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPGP40121 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPGP40121 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPGP40121 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPGP40121 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPGP40121 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPGP40121 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPGP40121 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPGP40121 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPGP40121 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPGP40121 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPGP40121 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPGP40121 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPGP40121 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPGP40121 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPGP40121 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPGP40121 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPGP40121 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPGP40121 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPGP40121 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPGP40121 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPGP40121 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPGP40121 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPGP40121 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPGP40121 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPGP40121 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPGP40121 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPGP40121 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPGP40121 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPGP40121 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPGP40121 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPGP40121 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPGP40121 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPGP40121 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPGP40121 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPGP40121 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPGP40121 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPGP40121 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPGP40121 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPGP40121 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPGP40121 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CAPGP40121 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPGP40121 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPGP40121 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPGP40121 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPGP40121 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPGP40121 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPGP40121 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPGP40121 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPGP40121 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPGP40121 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPGP40121 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPGP40121 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPGP40121 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPGP40121 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPGP40121 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPGP40121 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms