Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GGCXP38435 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGCXP38435 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGCXP38435 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGCXP38435 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGCXP38435 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGCXP38435 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGCXP38435 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGCXP38435 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGCXP38435 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGCXP38435 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGCXP38435 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGCXP38435 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGCXP38435 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GGCXP38435 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGCXP38435 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GGCXP38435 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGCXP38435 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GGCXP38435 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGCXP38435 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GGCXP38435 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGCXP38435 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGCXP38435 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGCXP38435 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GGCXP38435 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GGCXP38435 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GGCXP38435 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GGCXP38435 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GGCXP38435 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GGCXP38435 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GGCXP38435 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GGCXP38435 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GGCXP38435 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GGCXP38435 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GGCXP38435 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GGCXP38435 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GGCXP38435 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GGCXP38435 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GGCXP38435 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GGCXP38435 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GGCXP38435 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GGCXP38435 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GGCXP38435 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GGCXP38435 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GGCXP38435 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GGCXP38435 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GGCXP38435 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GGCXP38435 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GGCXP38435 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GGCXP38435 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GGCXP38435 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GGCXP38435 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GGCXP38435 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GGCXP38435 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GGCXP38435 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GGCXP38435 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GGCXP38435 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GGCXP38435 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GGCXP38435 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GGCXP38435 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GGCXP38435 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GGCXP38435 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GGCXP38435 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GGCXP38435 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GGCXP38435 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GGCXP38435 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GGCXP38435 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GGCXP38435 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GGCXP38435 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GGCXP38435 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GGCXP38435 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GGCXP38435 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GGCXP38435 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GGCXP38435 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GGCXP38435 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GGCXP38435 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GGCXP38435 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GGCXP38435 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GGCXP38435 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GGCXP38435 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GGCXP38435 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GGCXP38435 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GGCXP38435 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GGCXP38435 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GGCXP38435 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GGCXP38435 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GGCXP38435 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GGCXP38435 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GGCXP38435 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GGCXP38435 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GGCXP38435 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GGCXP38435 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GGCXP38435 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms