Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COPB2P35606 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPB2P35606 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPB2P35606 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPB2P35606 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPB2P35606 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPB2P35606 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPB2P35606 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPB2P35606 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPB2P35606 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPB2P35606 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPB2P35606 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPB2P35606 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPB2P35606 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPB2P35606 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COPB2P35606 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPB2P35606 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPB2P35606 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPB2P35606 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPB2P35606 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPB2P35606 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPB2P35606 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPB2P35606 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPB2P35606 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPB2P35606 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPB2P35606 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB2P35606 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB2P35606 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB2P35606 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB2P35606 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB2P35606 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB2P35606 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB2P35606 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB2P35606 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB2P35606 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB2P35606 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB2P35606 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB2P35606 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB2P35606 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB2P35606 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB2P35606 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB2P35606 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB2P35606 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB2P35606 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB2P35606 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB2P35606 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB2P35606 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB2P35606 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPB2P35606 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB2P35606 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB2P35606 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB2P35606 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB2P35606 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB2P35606 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB2P35606 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB2P35606 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB2P35606 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB2P35606 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB2P35606 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB2P35606 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB2P35606 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB2P35606 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB2P35606 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB2P35606 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB2P35606 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPB2P35606 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB2P35606 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB2P35606 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB2P35606 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB2P35606 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB2P35606 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB2P35606 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB2P35606 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB2P35606 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB2P35606 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB2P35606 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB2P35606 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB2P35606 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB2P35606 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB2P35606 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB2P35606 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB2P35606 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB2P35606 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB2P35606 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB2P35606 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB2P35606 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB2P35606 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPB2P35606 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPB2P35606 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPB2P35606 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPB2P35606 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPB2P35606 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPB2P35606 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPB2P35606 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPB2P35606 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPB2P35606 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPB2P35606 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPB2P35606 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COPB2P35606 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPB2P35606 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms