Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP6P35125 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
USP6P35125 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP6P35125 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
USP6P35125 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP6P35125 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP6P35125 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
USP6P35125 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP6P35125 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP6P35125 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP6P35125 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP6P35125 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP6P35125 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP6P35125 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP6P35125 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP6P35125 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP6P35125 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP6P35125 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP6P35125 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
USP6P35125 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP6P35125 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP6P35125 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP6P35125 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP6P35125 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
USP6P35125 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP6P35125 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP6P35125 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP6P35125 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6P35125 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6P35125 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6P35125 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6P35125 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6P35125 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6P35125 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6P35125 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6P35125 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6P35125 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6P35125 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6P35125 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6P35125 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6P35125 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6P35125 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6P35125 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6P35125 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6P35125 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6P35125 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6P35125 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6P35125 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6P35125 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP6P35125 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP6P35125 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP6P35125 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP6P35125 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP6P35125 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP6P35125 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP6P35125 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP6P35125 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP6P35125 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP6P35125 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP6P35125 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP6P35125 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP6P35125 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP6P35125 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP6P35125 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP6P35125 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP6P35125 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP6P35125 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP6P35125 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP6P35125 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP6P35125 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP6P35125 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP6P35125 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP6P35125 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP6P35125 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP6P35125 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP6P35125 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
USP6P35125 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP6P35125 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP6P35125 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP6P35125 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP6P35125 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP6P35125 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP6P35125 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP6P35125 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP6P35125 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP6P35125 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP6P35125 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP6P35125 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP6P35125 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP6P35125 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP6P35125 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP6P35125 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP6P35125 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP6P35125 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP6P35125 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
USP6P35125 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP6P35125 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP6P35125 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP6P35125 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP6P35125 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms