Protein–RNA interactions for Protein: P33261

CYP2C19, Cytochrome P450 2C19, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C19P33261 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CYP2C19P33261 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP2C19P33261 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms