Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL9P32969 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL9P32969 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL9P32969 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL9P32969 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL9P32969 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL9P32969 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL9P32969 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL9P32969 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL9P32969 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL9P32969 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL9P32969 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL9P32969 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL9P32969 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL9P32969 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL9P32969 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL9P32969 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL9P32969 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL9P32969 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL9P32969 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL9P32969 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL9P32969 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL9P32969 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL9P32969 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL9P32969 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL9P32969 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL9P32969 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL9P32969 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL9P32969 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL9P32969 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL9P32969 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL9P32969 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL9P32969 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL9P32969 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL9P32969 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL9P32969 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL9P32969 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL9P32969 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL9P32969 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL9P32969 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL9P32969 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL9P32969 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL9P32969 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL9P32969 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL9P32969 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL9P32969 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL9P32969 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL9P32969 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPL9P32969 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPL9P32969 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPL9P32969 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPL9P32969 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPL9P32969 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPL9P32969 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL9P32969 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL9P32969 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL9P32969 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL9P32969 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL9P32969 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL9P32969 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL9P32969 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL9P32969 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL9P32969 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL9P32969 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL9P32969 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL9P32969 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL9P32969 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL9P32969 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL9P32969 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL9P32969 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL9P32969 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL9P32969 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL9P32969 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL9P32969 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL9P32969 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL9P32969 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL9P32969 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL9P32969 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL9P32969 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL9P32969 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL9P32969 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL9P32969 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL9P32969 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL9P32969 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL9P32969 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL9P32969 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL9P32969 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL9P32969 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL9P32969 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL9P32969 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL9P32969 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL9P32969 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL9P32969 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL9P32969 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL9P32969 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL9P32969 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL9P32969 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL9P32969 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL9P32969 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL9P32969 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms