Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA7P31268 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA7P31268 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms