Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-DMAP28067 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms