Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
DNMT1P26358 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
DNMT1P26358 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms