Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNA2P26232 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA2P26232 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA2P26232 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA2P26232 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA2P26232 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA2P26232 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA2P26232 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA2P26232 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA2P26232 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA2P26232 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA2P26232 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA2P26232 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA2P26232 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA2P26232 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA2P26232 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA2P26232 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA2P26232 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNA2P26232 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms