Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSMA4P25789 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMA4P25789 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms