Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms