Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNE1P24864 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNE1P24864 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms