Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1P21675 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TAF1P21675 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TAF1P21675 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
TAF1P21675 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1P21675 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1P21675 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1P21675 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1P21675 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1P21675 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1P21675 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1P21675 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1P21675 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1P21675 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1P21675 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1P21675 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1P21675 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1P21675 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1P21675 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1P21675 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1P21675 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1P21675 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1P21675 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1P21675 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1P21675 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1P21675 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1P21675 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1P21675 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1P21675 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1P21675 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1P21675 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1P21675 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1P21675 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1P21675 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1P21675 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1P21675 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1P21675 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1P21675 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1P21675 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1P21675 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1P21675 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1P21675 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1P21675 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1P21675 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1P21675 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1P21675 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1P21675 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1P21675 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1P21675 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1P21675 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1P21675 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1P21675 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1P21675 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1P21675 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1P21675 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1P21675 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1P21675 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1P21675 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1P21675 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1P21675 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1P21675 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1P21675 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1P21675 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1P21675 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1P21675 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1P21675 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1P21675 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1P21675 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1P21675 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1P21675 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1P21675 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1P21675 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1P21675 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1P21675 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1P21675 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1P21675 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1P21675 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1P21675 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1P21675 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1P21675 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1P21675 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1P21675 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1P21675 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1P21675 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1P21675 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1P21675 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1P21675 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1P21675 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1P21675 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1P21675 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1P21675 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1P21675 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1P21675 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1P21675 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1P21675 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1P21675 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1P21675 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1P21675 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1P21675 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1P21675 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms