Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK11BP21127 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms