Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATP4AP20648 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP4AP20648 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms