Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5AP20339 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms