Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP2B1P20020 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B1P20020 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms