Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A1P19634 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC9A1P19634 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC9A1P19634 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC9A1P19634 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC9A1P19634 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC9A1P19634 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC9A1P19634 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A1P19634 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A1P19634 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A1P19634 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A1P19634 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A1P19634 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A1P19634 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A1P19634 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A1P19634 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A1P19634 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A1P19634 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A1P19634 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A1P19634 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A1P19634 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A1P19634 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A1P19634 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A1P19634 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A1P19634 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A1P19634 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A1P19634 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A1P19634 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A1P19634 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A1P19634 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A1P19634 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A1P19634 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A1P19634 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A1P19634 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms