Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF4P18085 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF4P18085 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF4P18085 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF4P18085 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF4P18085 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF4P18085 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF4P18085 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF4P18085 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF4P18085 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF4P18085 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF4P18085 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF4P18085 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF4P18085 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF4P18085 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF4P18085 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF4P18085 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF4P18085 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF4P18085 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF4P18085 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF4P18085 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF4P18085 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF4P18085 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF4P18085 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF4P18085 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF4P18085 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF4P18085 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF4P18085 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF4P18085 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF4P18085 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF4P18085 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF4P18085 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF4P18085 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF4P18085 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF4P18085 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF4P18085 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF4P18085 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF4P18085 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF4P18085 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARF4P18085 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARF4P18085 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARF4P18085 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARF4P18085 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARF4P18085 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARF4P18085 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARF4P18085 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARF4P18085 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARF4P18085 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARF4P18085 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARF4P18085 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARF4P18085 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARF4P18085 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARF4P18085 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARF4P18085 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARF4P18085 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF4P18085 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF4P18085 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF4P18085 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF4P18085 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF4P18085 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF4P18085 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF4P18085 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF4P18085 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF4P18085 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF4P18085 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF4P18085 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF4P18085 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF4P18085 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF4P18085 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF4P18085 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF4P18085 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF4P18085 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF4P18085 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF4P18085 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF4P18085 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF4P18085 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF4P18085 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF4P18085 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF4P18085 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF4P18085 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF4P18085 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF4P18085 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF4P18085 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF4P18085 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARF4P18085 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ARF4P18085 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ARF4P18085 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF4P18085 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF4P18085 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF4P18085 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF4P18085 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF4P18085 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF4P18085 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF4P18085 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF4P18085 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF4P18085 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF4P18085 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF4P18085 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF4P18085 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF4P18085 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms