Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD46P15529 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD46P15529 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD46P15529 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD46P15529 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD46P15529 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD46P15529 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD46P15529 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD46P15529 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD46P15529 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD46P15529 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD46P15529 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD46P15529 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD46P15529 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CD46P15529 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD46P15529 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD46P15529 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CD46P15529 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD46P15529 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD46P15529 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD46P15529 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD46P15529 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD46P15529 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD46P15529 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD46P15529 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD46P15529 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD46P15529 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD46P15529 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD46P15529 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD46P15529 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD46P15529 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD46P15529 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD46P15529 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD46P15529 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD46P15529 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD46P15529 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD46P15529 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD46P15529 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD46P15529 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD46P15529 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD46P15529 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD46P15529 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD46P15529 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD46P15529 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD46P15529 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD46P15529 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CD46P15529 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD46P15529 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD46P15529 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CD46P15529 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CD46P15529 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD46P15529 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CD46P15529 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD46P15529 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD46P15529 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD46P15529 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CD46P15529 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD46P15529 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD46P15529 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD46P15529 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD46P15529 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD46P15529 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD46P15529 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD46P15529 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CD46P15529 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD46P15529 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD46P15529 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD46P15529 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD46P15529 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD46P15529 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD46P15529 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD46P15529 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD46P15529 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD46P15529 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD46P15529 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD46P15529 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CD46P15529 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CD46P15529 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD46P15529 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD46P15529 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD46P15529 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD46P15529 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD46P15529 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD46P15529 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD46P15529 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD46P15529 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD46P15529 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD46P15529 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CD46P15529 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD46P15529 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD46P15529 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD46P15529 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD46P15529 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD46P15529 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD46P15529 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD46P15529 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD46P15529 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD46P15529 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD46P15529 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD46P15529 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms