Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA1P15085 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA1P15085 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA1P15085 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA1P15085 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA1P15085 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA1P15085 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA1P15085 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA1P15085 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA1P15085 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA1P15085 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA1P15085 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA1P15085 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA1P15085 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA1P15085 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA1P15085 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA1P15085 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA1P15085 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA1P15085 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA1P15085 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA1P15085 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA1P15085 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA1P15085 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA1P15085 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA1P15085 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA1P15085 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA1P15085 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA1P15085 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA1P15085 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA1P15085 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA1P15085 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA1P15085 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA1P15085 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA1P15085 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA1P15085 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA1P15085 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA1P15085 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPA1P15085 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPA1P15085 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPA1P15085 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPA1P15085 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPA1P15085 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CPA1P15085 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPA1P15085 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CPA1P15085 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPA1P15085 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CPA1P15085 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPA1P15085 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPA1P15085 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPA1P15085 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPA1P15085 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPA1P15085 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPA1P15085 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPA1P15085 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPA1P15085 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPA1P15085 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPA1P15085 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA1P15085 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA1P15085 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA1P15085 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA1P15085 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA1P15085 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA1P15085 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA1P15085 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA1P15085 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA1P15085 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA1P15085 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA1P15085 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA1P15085 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA1P15085 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA1P15085 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA1P15085 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA1P15085 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA1P15085 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA1P15085 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA1P15085 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA1P15085 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA1P15085 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA1P15085 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA1P15085 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA1P15085 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA1P15085 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA1P15085 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA1P15085 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA1P15085 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA1P15085 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA1P15085 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA1P15085 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA1P15085 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA1P15085 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA1P15085 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA1P15085 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA1P15085 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA1P15085 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA1P15085 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA1P15085 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA1P15085 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA1P15085 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA1P15085 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA1P15085 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms