Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA1P14867 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA1P14867 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms