Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFTRP13569 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFTRP13569 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFTRP13569 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFTRP13569 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFTRP13569 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFTRP13569 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFTRP13569 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFTRP13569 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFTRP13569 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFTRP13569 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFTRP13569 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CFTRP13569 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CFTRP13569 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CFTRP13569 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CFTRP13569 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CFTRP13569 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CFTRP13569 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CFTRP13569 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CFTRP13569 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CFTRP13569 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CFTRP13569 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CFTRP13569 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CFTRP13569 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CFTRP13569 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CFTRP13569 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CFTRP13569 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CFTRP13569 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CFTRP13569 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CFTRP13569 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CFTRP13569 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CFTRP13569 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CFTRP13569 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CFTRP13569 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CFTRP13569 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CFTRP13569 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
CFTRP13569 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CFTRP13569 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CFTRP13569 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
CFTRP13569 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CFTRP13569 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CFTRP13569 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CFTRP13569 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CFTRP13569 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CFTRP13569 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CFTRP13569 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CFTRP13569 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
CFTRP13569 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CFTRP13569 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
CFTRP13569 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CFTRP13569 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CFTRP13569 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CFTRP13569 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CFTRP13569 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CFTRP13569 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CFTRP13569 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CFTRP13569 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CFTRP13569 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CFTRP13569 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CFTRP13569 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CFTRP13569 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CFTRP13569 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CFTRP13569 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CFTRP13569 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CFTRP13569 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CFTRP13569 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CFTRP13569 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CFTRP13569 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CFTRP13569 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CFTRP13569 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
CFTRP13569 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CFTRP13569 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CFTRP13569 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CFTRP13569 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CFTRP13569 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CFTRP13569 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CFTRP13569 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CFTRP13569 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CFTRP13569 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
CFTRP13569 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
CFTRP13569 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CFTRP13569 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CFTRP13569 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CFTRP13569 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CFTRP13569 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CFTRP13569 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CFTRP13569 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CFTRP13569 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CFTRP13569 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CFTRP13569 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CFTRP13569 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CFTRP13569 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CFTRP13569 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CFTRP13569 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CFTRP13569 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CFTRP13569 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CFTRP13569 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CFTRP13569 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CFTRP13569 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CFTRP13569 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms