Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG2P13521 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG2P13521 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG2P13521 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG2P13521 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG2P13521 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG2P13521 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG2P13521 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG2P13521 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG2P13521 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG2P13521 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG2P13521 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG2P13521 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG2P13521 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG2P13521 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG2P13521 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG2P13521 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG2P13521 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG2P13521 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG2P13521 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG2P13521 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG2P13521 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG2P13521 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG2P13521 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG2P13521 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG2P13521 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG2P13521 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG2P13521 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG2P13521 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG2P13521 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG2P13521 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG2P13521 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG2P13521 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG2P13521 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG2P13521 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG2P13521 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG2P13521 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG2P13521 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG2P13521 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG2P13521 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG2P13521 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SCG2P13521 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCG2P13521 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCG2P13521 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCG2P13521 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCG2P13521 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCG2P13521 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCG2P13521 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCG2P13521 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCG2P13521 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCG2P13521 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCG2P13521 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCG2P13521 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCG2P13521 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCG2P13521 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCG2P13521 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCG2P13521 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCG2P13521 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCG2P13521 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCG2P13521 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCG2P13521 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCG2P13521 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCG2P13521 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCG2P13521 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCG2P13521 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCG2P13521 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCG2P13521 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCG2P13521 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG2P13521 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG2P13521 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG2P13521 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG2P13521 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG2P13521 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG2P13521 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG2P13521 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG2P13521 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG2P13521 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG2P13521 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG2P13521 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG2P13521 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG2P13521 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG2P13521 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG2P13521 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG2P13521 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG2P13521 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG2P13521 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG2P13521 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG2P13521 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG2P13521 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG2P13521 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG2P13521 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG2P13521 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG2P13521 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG2P13521 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG2P13521 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG2P13521 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG2P13521 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG2P13521 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG2P13521 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG2P13521 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms