Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
GP1BBP13224 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms