Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms