Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
TOP2AP11388 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TOP2AP11388 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms