Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP1P11387 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP1P11387 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP1P11387 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP1P11387 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP1P11387 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP1P11387 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP1P11387 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP1P11387 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP1P11387 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP1P11387 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP1P11387 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP1P11387 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP1P11387 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP1P11387 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP1P11387 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP1P11387 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP1P11387 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP1P11387 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP1P11387 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP1P11387 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP1P11387 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP1P11387 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP1P11387 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP1P11387 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP1P11387 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP1P11387 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP1P11387 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP1P11387 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP1P11387 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP1P11387 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP1P11387 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP1P11387 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP1P11387 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP1P11387 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP1P11387 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP1P11387 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP1P11387 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP1P11387 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP1P11387 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP1P11387 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1P11387 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1P11387 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1P11387 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1P11387 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1P11387 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1P11387 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1P11387 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1P11387 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1P11387 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1P11387 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1P11387 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1P11387 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1P11387 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1P11387 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1P11387 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1P11387 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1P11387 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1P11387 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP1P11387 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1P11387 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1P11387 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1P11387 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1P11387 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1P11387 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1P11387 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1P11387 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1P11387 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1P11387 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1P11387 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1P11387 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1P11387 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1P11387 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1P11387 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1P11387 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1P11387 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1P11387 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1P11387 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1P11387 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1P11387 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1P11387 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1P11387 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1P11387 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1P11387 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1P11387 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1P11387 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1P11387 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1P11387 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP1P11387 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1P11387 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1P11387 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1P11387 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1P11387 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1P11387 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1P11387 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1P11387 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1P11387 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1P11387 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1P11387 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1P11387 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms