Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGAMP11215 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGAMP11215 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms