Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RARBP10826 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARBP10826 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARBP10826 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARBP10826 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARBP10826 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARBP10826 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARBP10826 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARBP10826 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARBP10826 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARBP10826 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARBP10826 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RARBP10826 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARBP10826 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARBP10826 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARBP10826 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARBP10826 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARBP10826 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARBP10826 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARBP10826 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARBP10826 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARBP10826 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARBP10826 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RARBP10826 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARBP10826 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARBP10826 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARBP10826 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARBP10826 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARBP10826 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARBP10826 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARBP10826 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARBP10826 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARBP10826 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARBP10826 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARBP10826 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARBP10826 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARBP10826 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARBP10826 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARBP10826 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARBP10826 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARBP10826 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RARBP10826 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARBP10826 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RARBP10826 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RARBP10826 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARBP10826 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RARBP10826 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARBP10826 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARBP10826 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARBP10826 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARBP10826 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARBP10826 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARBP10826 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARBP10826 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RARBP10826 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARBP10826 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARBP10826 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARBP10826 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARBP10826 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARBP10826 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARBP10826 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARBP10826 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARBP10826 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARBP10826 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARBP10826 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARBP10826 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARBP10826 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARBP10826 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARBP10826 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARBP10826 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARBP10826 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARBP10826 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARBP10826 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARBP10826 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARBP10826 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RARBP10826 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARBP10826 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARBP10826 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARBP10826 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARBP10826 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARBP10826 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARBP10826 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RARBP10826 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARBP10826 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARBP10826 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RARBP10826 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARBP10826 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARBP10826 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARBP10826 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARBP10826 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARBP10826 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARBP10826 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARBP10826 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RARBP10826 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARBP10826 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARBP10826 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARBP10826 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARBP10826 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARBP10826 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARBP10826 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms