Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GLI3P10071 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GLI3P10071 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GLI3P10071 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GLI3P10071 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GLI3P10071 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GLI3P10071 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GLI3P10071 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GLI3P10071 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GLI3P10071 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GLI3P10071 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GLI3P10071 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GLI3P10071 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GLI3P10071 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GLI3P10071 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GLI3P10071 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GLI3P10071 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GLI3P10071 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GLI3P10071 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GLI3P10071 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GLI3P10071 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GLI3P10071 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GLI3P10071 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GLI3P10071 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GLI3P10071 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GLI3P10071 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GLI3P10071 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GLI3P10071 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GLI3P10071 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GLI3P10071 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GLI3P10071 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GLI3P10071 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GLI3P10071 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GLI3P10071 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GLI3P10071 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GLI3P10071 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GLI3P10071 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GLI3P10071 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GLI3P10071 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GLI3P10071 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GLI3P10071 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GLI3P10071 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GLI3P10071 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GLI3P10071 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GLI3P10071 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GLI3P10071 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GLI3P10071 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GLI3P10071 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GLI3P10071 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GLI3P10071 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GLI3P10071 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GLI3P10071 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GLI3P10071 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GLI3P10071 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GLI3P10071 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GLI3P10071 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GLI3P10071 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GLI3P10071 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GLI3P10071 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GLI3P10071 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GLI3P10071 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GLI3P10071 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GLI3P10071 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GLI3P10071 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GLI3P10071 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GLI3P10071 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GLI3P10071 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GLI3P10071 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GLI3P10071 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GLI3P10071 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GLI3P10071 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GLI3P10071 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GLI3P10071 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GLI3P10071 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GLI3P10071 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GLI3P10071 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GLI3P10071 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GLI3P10071 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GLI3P10071 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GLI3P10071 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GLI3P10071 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GLI3P10071 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GLI3P10071 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GLI3P10071 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GLI3P10071 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GLI3P10071 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GLI3P10071 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GLI3P10071 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GLI3P10071 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GLI3P10071 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GLI3P10071 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GLI3P10071 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GLI3P10071 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GLI3P10071 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GLI3P10071 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GLI3P10071 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GLI3P10071 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GLI3P10071 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GLI3P10071 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GLI3P10071 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms