Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
U2AF1L5P0DN76 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
U2AF1L5P0DN76 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
U2AF1L5P0DN76 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
U2AF1L5P0DN76 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
U2AF1L5P0DN76 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
U2AF1L5P0DN76 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
U2AF1L5P0DN76 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms