Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf88P0DMB2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms