Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RGPD1P0DJD0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RGPD1P0DJD0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms