Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00869P0C866 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms