Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC175P0C221 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC175P0C221 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC175P0C221 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC175P0C221 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC175P0C221 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC175P0C221 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC175P0C221 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC175P0C221 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC175P0C221 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC175P0C221 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC175P0C221 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC175P0C221 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC175P0C221 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC175P0C221 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC175P0C221 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC175P0C221 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC175P0C221 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC175P0C221 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC175P0C221 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC175P0C221 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC175P0C221 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC175P0C221 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC175P0C221 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC175P0C221 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC175P0C221 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC175P0C221 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC175P0C221 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC175P0C221 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC175P0C221 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC175P0C221 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC175P0C221 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC175P0C221 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC175P0C221 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC175P0C221 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC175P0C221 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC175P0C221 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC175P0C221 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC175P0C221 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC175P0C221 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC175P0C221 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC175P0C221 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC175P0C221 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC175P0C221 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC175P0C221 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC175P0C221 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC175P0C221 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC175P0C221 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC175P0C221 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC175P0C221 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC175P0C221 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC175P0C221 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC175P0C221 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC175P0C221 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC175P0C221 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC175P0C221 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC175P0C221 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC175P0C221 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC175P0C221 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC175P0C221 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC175P0C221 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC175P0C221 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC175P0C221 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC175P0C221 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC175P0C221 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC175P0C221 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC175P0C221 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC175P0C221 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms