Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms