Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms