Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D2O95562 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms