Protein–RNA interactions for Protein: O95377

GJB5, Gap junction beta-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB5O95377 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB5O95377 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GJB5O95377 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB5O95377 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GJB5O95377 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB5O95377 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB5O95377 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB5O95377 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GJB5O95377 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB5O95377 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB5O95377 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB5O95377 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB5O95377 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB5O95377 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GJB5O95377 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GJB5O95377 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GJB5O95377 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB5O95377 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB5O95377 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GJB5O95377 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB5O95377 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB5O95377 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB5O95377 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GJB5O95377 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB5O95377 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB5O95377 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB5O95377 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB5O95377 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB5O95377 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB5O95377 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB5O95377 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB5O95377 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB5O95377 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB5O95377 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB5O95377 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB5O95377 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB5O95377 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB5O95377 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB5O95377 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB5O95377 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB5O95377 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB5O95377 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB5O95377 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB5O95377 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB5O95377 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB5O95377 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB5O95377 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB5O95377 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB5O95377 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB5O95377 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB5O95377 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB5O95377 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB5O95377 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB5O95377 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GJB5O95377 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GJB5O95377 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB5O95377 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB5O95377 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB5O95377 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB5O95377 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB5O95377 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB5O95377 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB5O95377 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB5O95377 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJB5O95377 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB5O95377 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GJB5O95377 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GJB5O95377 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJB5O95377 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJB5O95377 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB5O95377 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB5O95377 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB5O95377 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB5O95377 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB5O95377 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB5O95377 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB5O95377 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB5O95377 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB5O95377 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB5O95377 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB5O95377 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB5O95377 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB5O95377 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB5O95377 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB5O95377 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB5O95377 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB5O95377 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB5O95377 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB5O95377 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB5O95377 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB5O95377 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB5O95377 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB5O95377 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJB5O95377 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB5O95377 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB5O95377 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB5O95377 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB5O95377 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB5O95377 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJB5O95377 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms