Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPO95166 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms