Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SKAP2O75563 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms