Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF40AO75400 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms