Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRD4O60885 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRD4O60885 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD4O60885 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD4O60885 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD4O60885 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD4O60885 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD4O60885 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD4O60885 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD4O60885 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD4O60885 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD4O60885 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD4O60885 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD4O60885 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD4O60885 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD4O60885 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD4O60885 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD4O60885 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD4O60885 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD4O60885 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRD4O60885 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRD4O60885 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRD4O60885 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRD4O60885 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
BRD4O60885 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRD4O60885 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRD4O60885 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRD4O60885 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
BRD4O60885 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRD4O60885 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRD4O60885 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRD4O60885 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRD4O60885 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRD4O60885 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRD4O60885 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD4O60885 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD4O60885 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD4O60885 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD4O60885 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD4O60885 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD4O60885 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD4O60885 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD4O60885 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD4O60885 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD4O60885 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD4O60885 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD4O60885 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD4O60885 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD4O60885 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRD4O60885 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRD4O60885 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRD4O60885 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRD4O60885 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRD4O60885 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRD4O60885 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
BRD4O60885 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRD4O60885 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRD4O60885 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRD4O60885 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRD4O60885 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BRD4O60885 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BRD4O60885 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
BRD4O60885 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
BRD4O60885 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
BRD4O60885 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRD4O60885 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRD4O60885 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRD4O60885 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRD4O60885 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRD4O60885 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRD4O60885 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRD4O60885 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRD4O60885 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
BRD4O60885 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRD4O60885 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRD4O60885 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRD4O60885 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
BRD4O60885 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRD4O60885 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRD4O60885 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRD4O60885 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRD4O60885 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRD4O60885 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRD4O60885 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRD4O60885 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRD4O60885 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRD4O60885 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRD4O60885 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRD4O60885 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
BRD4O60885 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
BRD4O60885 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRD4O60885 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRD4O60885 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
BRD4O60885 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRD4O60885 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRD4O60885 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRD4O60885 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRD4O60885 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRD4O60885 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRD4O60885 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms