Protein–RNA interactions for Protein: O60232

SSSCA1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSSCA1O60232 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSSCA1O60232 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSSCA1O60232 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms