Protein–RNA interactions for Protein: O43824

GTPBP6, Putative GTP-binding protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP6O43824 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTPBP6O43824 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTPBP6O43824 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTPBP6O43824 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTPBP6O43824 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTPBP6O43824 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTPBP6O43824 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTPBP6O43824 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GTPBP6O43824 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTPBP6O43824 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTPBP6O43824 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTPBP6O43824 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTPBP6O43824 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTPBP6O43824 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTPBP6O43824 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTPBP6O43824 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTPBP6O43824 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTPBP6O43824 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTPBP6O43824 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTPBP6O43824 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTPBP6O43824 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTPBP6O43824 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTPBP6O43824 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GTPBP6O43824 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTPBP6O43824 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTPBP6O43824 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms