Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRNO43815 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRNO43815 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRNO43815 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
STRNO43815 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRNO43815 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
STRNO43815 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRNO43815 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRNO43815 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRNO43815 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRNO43815 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRNO43815 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRNO43815 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRNO43815 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRNO43815 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRNO43815 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRNO43815 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRNO43815 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRNO43815 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRNO43815 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRNO43815 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
STRNO43815 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
STRNO43815 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRNO43815 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRNO43815 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
STRNO43815 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRNO43815 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRNO43815 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRNO43815 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRNO43815 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRNO43815 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRNO43815 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRNO43815 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRNO43815 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRNO43815 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRNO43815 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRNO43815 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRNO43815 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STRNO43815 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRNO43815 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STRNO43815 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STRNO43815 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRNO43815 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRNO43815 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRNO43815 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRNO43815 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRNO43815 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRNO43815 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRNO43815 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRNO43815 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRNO43815 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRNO43815 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRNO43815 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRNO43815 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRNO43815 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRNO43815 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
STRNO43815 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STRNO43815 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STRNO43815 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRNO43815 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRNO43815 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRNO43815 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STRNO43815 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRNO43815 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRNO43815 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRNO43815 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STRNO43815 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRNO43815 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRNO43815 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRNO43815 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRNO43815 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRNO43815 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRNO43815 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRNO43815 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRNO43815 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRNO43815 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRNO43815 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRNO43815 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRNO43815 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRNO43815 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRNO43815 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRNO43815 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRNO43815 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRNO43815 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRNO43815 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STRNO43815 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STRNO43815 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRNO43815 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRNO43815 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRNO43815 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRNO43815 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRNO43815 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STRNO43815 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRNO43815 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRNO43815 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRNO43815 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STRNO43815 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRNO43815 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRNO43815 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRNO43815 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms